Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwistnbQ78WZ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms