Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ubfd1Q78JW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ubfd1Q78JW9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ubfd1Q78JW9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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