Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stambpl1Q76N33 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stambpl1Q76N33 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms