Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cspg5Q71M36 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cspg5Q71M36 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cspg5Q71M36 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cspg5Q71M36 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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