Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp34Q6ZQ93 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms