Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms