Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ssx9Q6XAS3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ssx9Q6XAS3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssx9Q6XAS3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssx9Q6XAS3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssx9Q6XAS3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms