Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms