Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt9Q6RHW0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt9Q6RHW0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt9Q6RHW0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms