Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac4Q6NZM9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac4Q6NZM9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac4Q6NZM9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac4Q6NZM9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms