Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmcc1Q69ZZ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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