Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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