Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms