Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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