Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vat1Q62465 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vat1Q62465 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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