Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcncQ62447 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms