Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5dQ62240 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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Kdm5dQ62240 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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Kdm5dQ62240 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm5dQ62240 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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