Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six2Q62232 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six2Q62232 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms