Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sema3bQ62177 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sema3bQ62177 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms