Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms