Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprrQ62132 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtprrQ62132 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprrQ62132 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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