Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npm1Q61937 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npm1Q61937 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms