Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sim1Q61045 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sim1Q61045 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sim1Q61045 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sim1Q61045 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms