Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
JrkQ60976 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
JrkQ60976 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms