Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp4Q60972 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms