Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurod1Q60867 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms