Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mkrn3Q60764 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mkrn3Q60764 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms