Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3aQ60520 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms