Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf12Q5SPL2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms