Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynaQ5G5D5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms