Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2bQ56A07 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn2bQ56A07 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms