Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm6Q3UZD5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms