Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnpc3Q3UZ01 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms