Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29609Q3UU56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29609Q3UU56 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29609Q3UU56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm29609Q3UU56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29609Q3UU56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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