Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms