Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp30Q3UN04 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp30Q3UN04 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp30Q3UN04 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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