Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB2

Znhit6, Box C/D snoRNA protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit6Q3UFB2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Znhit6Q3UFB2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znhit6Q3UFB2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms