Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms