Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Kdm4dQ3U2K5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4dQ3U2K5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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