Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc9Q3U0M1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms