Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms