Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Spatc1Q148B6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spatc1Q148B6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spatc1Q148B6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spatc1Q148B6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spatc1Q148B6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spatc1Q148B6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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