Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col19a1Q0VF58 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms