Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms