Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms