Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms