Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgm3Q08189 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tgm3Q08189 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgm3Q08189 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgm3Q08189 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms