Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntn3Q07409 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms