Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms