Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd1Q04519 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms